今天，我们为大家解析的是卑尔根大学的博士研究项目。
“ PhD student, Virtual screening and design of riboswitch ligands ”
学校及院系介绍
学校概况:
卑尔根大学(University of Bergen)成立于1946年,是挪威顶尖的综合性大学之一。学校位于挪威第二大城市卑尔根,环境优美,学术氛围浓厚。学校设有7个学院,涵盖人文、社科、理工、医学等领域,在校学生约17,000人。
院系介绍:
生物医学系是卑尔根大学医学院下属的重要院系之一。该系拥有一支国际化的教授团队,科研设备先进,与制药企业有密切合作。本项目导师Ruth Brenk教授是结构生物学与药物发现领域的知名专家。
项目专业介绍
本次招生专业为生物医学专业下的RNA药物设计方向。该方向旨在培养具备跨学科背景的RNA靶向药物研发人才,重点关注抗菌药物的开发。毕业生将成为推动RNA药物研发的新生力量,就业前景广阔。
申请要求
1.学历要求:
- 持有计算化学、化学信息学、医药化学、药学或相关学科的硕士学位(或同等学历)
- 硕士学位需等同于挪威5年制硕士学位
- 2024年11月1日前完成硕士学位
2.专业背景:
- 具有化学信息学或基于结构的药物设计的实践和理论背景
- 具备基本的编程技能
- 熟悉Python和RDKit优先
- 有基于结构的虚拟筛选经验优先
3.语言要求:
- 英语听说读写流利
4.其他要求:
-
- 对RNA配体发现和TargetRNA网络研究有浓厚兴趣
- 具有独立工作和团队合作能力
- 工作方法系统,沟通能力强
- 具有创新精神和发展潜力
项目特色与优势
- 跨学科培养:
结合分子生物学、结构生物学、生物物理学、计算化学、合成与药物化学、微生物学等多学科知识
- 产学研结合:
与制药企业合作,推动科研成果转化
- 国际化视野:
参与国际学术会议,进行海外访学
- 软实力培养:
FAIR数据原则、负责任创新等
有话说
项目理解
1.交叉学科：
- 项目属于RNA靶向药物设计领域
- 涉及分子生物学、结构生物学、计算化学、药物化学和微生物学等多个学科
2.研究目标：
- 为SAM-III、SAM-I/IV和FMN核糖开关发现和优化新型小分子配体
- 为抗菌药物开发提供新的靶点和先导化合物
3.技术手段：
- 采用基于结构的虚拟筛选
- 使用片段筛选和类似物设计等计算化学方法
- 结合X射线晶体学等实验技术
4.理论贡献：
- 深化对RNA-小分子相互作用的理解
- 为RNA药物设计提供新的理论指导
- 扩展PanDDA软件功能，用于处理RNA晶体数据
- 为RNA结构生物学研究提供新的分析工具
5.应用价值：
- 直接应用于新型抗菌药物的开发
- 有助于解决细菌耐药性问题
- 开发的方法和工具可能应用于其他疾病领域（如癌症和神经退行性疾病）
创新思考
1.前沿方向：
- 向RNA表观遗传学领域延伸
- 探索RNA纳米技术等新兴领域
- 研究RNA在更广泛生物学过程中的调控作用
2.技术手段：
- 引入人工智能和机器学习方法（如深度学习模型）
- 结合单分子实时测序技术(SMRT)等新型实验方法
- 提高虚拟筛选的准确性和效率
- 更精确地研究RNA-配体相互作用的动态过程
3.理论框架：
- 构建RNA药物设计的通用理论模型
- 整合RNA结构、动力学和热力学特性
- 为RNA靶向药物的理性设计提供系统指导
4.应用拓展：
- 开发调节基因表达的RNA靶向药物
- 应用于遗传性疾病或癌症的治疗
5.实践意义：
- 加强与制药企业的合作
- 建立从基础研究到临床应用的完整转化医学链条
- 加速研究成果的实际应用
6.国际视野：
- 建立全球性的RNA药物研发联盟
- 整合不同国家和地区的研究资源
- 提高项目的国际影响力
7.交叉创新：
- 将RNA药物设计与纳米技术、生物材料学等领域结合
- 开发新型的RNA药物递送系统
8。其他创新点：
- 探索RNA药物的个体化设计策略，考虑患者的基因组和转录组特征
- 研究RNA药物与传统小分子药物的协同作用，开发组合治疗方案
- 利用合成生物学方法，设计和构建人工RNA开关，用于精确调控基因表达或作为生物传感器
博士背景
Owen，美国top10高校化学系博士生，专攻有机合成方法学与药物化学研究。擅长运用绿色化学原理和流动化学技术开发高效、环保的有机反应。在开发新型抗癌药物前体化合物方面取得突破性进展。曾获美国化学会有机化学部门杰出青年研究员奖，研究成果发表于《Journal of the American Chemical Society》和《Angewandte Chemie》等顶级期刊。
【竞赛报名/项目咨询请加微信：mollywei007】
