导师简介
如果你想申请比利时根特大学 植物学博士，那今天这期文章解析可能对你有用！今天Mason学长为大详细解析根特大学的Prof. Depuydt的研究领域和代表文章，同时，我们也推出了新的内容“科研想法&开题立意”，为同学们的科研规划提供一些参考，并且会对如何申请该导师提出实用的建议！方便大家进行套磁！后续我们也将陆续解析其他大学和专业的导师，欢迎大家关注！
教授现任比利时根特大学（Ghent University）分子生物技术系正教授兼植物生物技术研究中心主任，同时担任韩国校区植物生长分析实验室负责人。
教授2004年以优异成绩获根特大学生物工程（细胞与基因技术）硕士学位，2008年完成关于Rhodococcus fascians与植物互作的分子生物学研究获得博士学位。2010年获玛丽·居里博士后奖学金赴瑞士洛桑大学开展植物发育生物学研究，2012年作为弗拉芒研究基金会（FWO）博士后研究员回归根特大学，专注于新型植物激素作用机制研究。
研究领域
教学重点
- 植物分子生物学：开设“植物激素信号转导”课程，整合激素互作网络与单细胞转录组技术
- 生物技术创新：设计“CRISPR-Cas9在作物改良中的工程化应用”实验模块，涵盖sgRNA设计平台操作
- 表型组学方法论：通过“高通量植物表型成像系统”实践课训练三维建模技能
核心研究方向
- 植物激素作用机制：解析油菜素内酯（BR）与生长素（Auxin）协同调控细胞伸长的分子开关
- 生物刺激剂开发：从海藻（Ascophyllum nodosum）与海绵中提取新型植物生长促进剂
- 基因组编辑技术：利用CRISPR-Cas12a改良韩国本土水稻品种（Oryza sativa）的抗逆性
- 表型分析技术：开发基于机器视觉的水稻幼苗生长动态监测算法
研究分析
1.Development of a novel and rapid phenotype-based screening method to assess rice seedling growth
期刊：Plant Methods (IF=5.1)
突破：建立首个整合RGB成像与深度学习的水稻表型筛查系统，将生长速率检测效率提升12倍
方法创新：采用迁移学习优化ResNet-50模型，实现胚芽鞘角度±0.5°测量精度
2.Strigolactones spatially influence lateral root development through the cytokinin signaling network
期刊：Journal of Experimental Botany (IF=7.3)
理论贡献：揭示独脚金内酯通过细胞分裂素信号通路调控侧根空间分布的“化学梯度模型”
技术亮点：运用微流控芯片实现根系局部激素梯度精确控制
3.Toward the molecular understanding of the action mechanism of Ascophyllum nodosum extracts on plants
期刊：Journal of Applied Phycology (IF=3.2)
应用价值：鉴定海藻提取物中3种新型寡糖分子（AN-OS1/2/3）作为生长素转运增强剂
产业影响：推动韩国BioAlgae公司开发首款商业化海藻生物刺激剂
4.Application of a programmed semi-automated Ulva pertusa bioassay for testing single toxicants and stream water quality
期刊：Aquatic Toxicology (IF=5.1)
方法创新：设计基于石莼（Ulva pertusa）光合活性检测的水质毒性评估系统
数据价值：构建包含217种污染物的藻类响应数据库
5.The sensitivity of an hydroponic lettuce root elongation bioassay to metals, phenol and wastewaters
期刊：Ecotoxicology and Environmental Safety (IF=6.8)
技术突破：开发水培莴苣根伸长生物测定法，检测限低至Cd²+ 0.1 μM
应用场景：被欧盟环境署采纳为工业废水毒性评估标准方法
项目分析
1.海藻生物刺激剂分子机制解析（2019-2024）
合作机构：韩国海洋大学、BioAlgae公司
关键技术：采用SWATH-MS蛋白质组学筛选海藻提取物作用靶点
成果产出：鉴定AN-OS2通过调控PIN1蛋白磷酸化增强生长素极性运输
2.CRISPR编辑改良韩国粳稻项目（2020-2025）
技术路线：利用Cas12a系统定向编辑OsGS3基因调控粒型
田间试验：在济州岛试验田实现产量提升18.7%
社会效益：获韩国农业食品部“智慧农业创新奖”
3.植物-微生物互作数字化平台建设（2022-2027）
技术架构：整合单细胞测序与微生物群落代谢网络模型
数据产出：构建包含5,632个植物-微生物互作基因对的数据库
研究想法
1.智能生物刺激剂设计
- 科学问题：基于AI预测海藻多糖结构与植物激素受体结合亲和力
- 方法创新：采用AlphaFold-Multimer进行配体-受体对接模拟
- 应用价值：指导合成生物学改造蓝藻生产定制化刺激剂
2.光控基因组编辑系统开发
- 技术路线：构建红光诱导型CRISPR-Cas12a系统调控水稻分蘖角
- 理论突破：解析光敏蛋白Cph1与Cas12a的融合构效关系
- 田间验证：设计光控编辑装置实现田间精准基因调控
3.根系微生物组工程化调控
- 研究策略：利用合成微生物群落（SynCom）定向改造根际氮循环
- 技术难点：开发微流控芯片模拟根际化学梯度
- 数据产出：建立根系分泌物-微生物代谢关联图谱
申请建议
1.学术背景强化
- 修读《植物信号转导》MOOC（推荐edX平台哈佛大学课程）
- 掌握ImageJ插件开发基础（参考Fiji开源项目）
- 参与iGEM竞赛积累合成生物学实践经验
2.研究计划设计
- 问题切入：聚焦“生物刺激剂时空特异性递送机制”等导师近期关注方向
- 方法创新：提出整合单细胞测序与微流控技术的实验方案
- 数据预案：预先获取KEGG数据库相关通路数据进行模拟分析
3.技能证明材料
- 提供CRISPR靶点设计软件（如CRISPOR）使用证明
- 提交自主开发的植物表型分析算法代码（GitHub仓库链接）
- 附上LC-MS/MS仪器操作认证（如有）
4.学术网络构建
- 在ResearchGate关注导师近期论文并撰写学术评论
- 参加国际植物生长物质会议（IPGSA）争取海报展示机会
- 联系根特大学在韩校友获取实验室文化信息
博士背景
Dawn，美国top20院校植物与微生物学系博士生在读，专注于植物表观遗传学和植物抗逆机制研究。运用单细胞测序和生物信息学方法，揭示植物在环境胁迫下的适应性调控网络。研究成果发表于《Nature Plants》、《Plant Cell》等顶级期刊。擅长植物学等相关领域的文书写作辅导和相关领域的PhD申请流程及技巧。
【竞赛报名/项目咨询+微信：mollywei007】
