有迹象表明，美国博士生申请的难度将会显著增加，原因多方面交织，影响深远。首先，科研经费的下降是导致申请难度加大的核心因素之一。许多大学和研究机构依赖于充足的科研经费来资助博士生的研究项目、奖学金以及助教岗位等。而随着政府和科研机构预算的削减，资金支持变得更加紧张，这直接影响了实验室的规模与资源分配，导致一些导师无法为博士生提供足够的资助。资金的紧缩使得高校不得不收缩博士生招生计划，减少接收的博士生数量，导致潜在申请者面临更为激烈的竞争。
《科学》杂志报道称，白宫计划将美国国家科学基金会（NSF）的预算削减至30亿美元，相较于当前的91亿美元，削减幅度几乎达2/3。报道指出，NSF预算的削减将极大降低研究人员获得资助的机会，目前的成功率为四分之一，未来可能仅有十分之一。
在社交媒体上，马斯克曾公开表示：“你们能相信吗？一些拥有数百亿美元捐赠的大学竟然从研究经费中提取60%作为管理费用，简直是敲竹杠！”间接经费，作为自1950年代起便存在的一种资金支出，通常包括水电费、设备维护等必要成本。虽然这些费用在私人基金会中归入直接经费，但政府资助要求这些费用必须计入间接经费，因此其比例往往较高。例如，哈佛大学的间接成本费率为69%，耶鲁大学为67.5%，而德克萨斯大学的费率为59%。这也是马斯克对“敲竹杠”现象的不满所在。
特朗普政府还计划在未来两个月内裁员25%-50%。在这次大规模裁员计划中，NSF也难逃厄运。特朗普和马斯克希望减少联邦政府10%的员工，其中许多NSF职员已签署辞职协议。专家指出，如果这些削减继续下去，美国在全球科学技术领域的领导地位将受到严重威胁。一位NSF项目经理表示，削减预算近半将摧毁美国在全球科研领域的主导地位。
此外，博士生的录取标准也因此提高。为了应对竞争压力，许多高校提高了对申请者的要求，包括学术成绩、研究经验、推荐信等方面。申请者不仅需要具备优秀的学术背景，还必须展现出能够独立开展研究的潜力和能力。与此同时，科研资金的紧缩也使得许多高等院校在处理国际学生的资助时变得更加保守，减少了奖学金和助学金的提供，这进一步增加了国际学生申请的难度。
特朗普政府及政府效率部提出的政策削减和审查，尤其是对科研经费的紧缩，也对博士生的招生产生了影响。许多博士生导师和研究人员因为经费限制，无法继续支持原本计划的研究项目，甚至有部分课题和实验室面临关闭的风险。这些变化使得科研环境更加紧张，博士生的招生和资助机会大幅减少。
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