单纯生信是否好发?前景如何?

铛铛档,今天是久违的医学Q&A专场。生信这两年特别火,可就业前景是否真的明朗,单纯生信又是否好发?涉及人体的菌落标本或者细菌培养类研究,是否需要伦理?

小e来给您一一解答?

问:单纯生信是否好发?前景如何?

答:常规生信文章目前发表前景有限,普遍1-3分。影像学分析、空间转录组测序、单细胞测序等,由于需要耗费大量经费和需要技术难度门槛,是生信类文章中相对好发的。

生信类的文章当前大的行业前景是结合大量测序、机器学习以及湿实验验证为主。小的行业前景,一是不断开发新的分析模型、机器学习等更为高深的生信分析方法;二是转为分析数据量更多、难度更大、精度更高的测序数据,如空间转录组测序、单细胞测序等。

如果是只发单纯生信的话,难度相较于之前更大,只能在小的发展前景上不断内卷。如需要在编程分析上进行提升,使用更高级的分析模型、使用数据量大的疾病模型等等,力求得出更为有意义、统计分析更严谨得结论。

不然,单纯生信得出来的结论往往重点不够,可信度较低,需要结合一部分的验证实验来发表。或者是不使用公共数据库,而使用自己纳入样本进行测序的数据库,相对会更好发表。同时,一些分析难度较大的测序数据,如单细胞测序、空间转录组测序等等的二次分析的文章发表相对比较容易。

问:涉及人体的菌落标本或者细菌培养类研究,是否需要伦理?

答:严格来说,凡是实验过程涉及人体以及人体来源的样本、人胚胎干细胞的科学研究均需通过伦理审查。比如对人体进行观察、检查、治疗、收集人体组织标本、血液和分泌物、以及对人体病理资料和临床资料的回顾性分析、利用人胚胎干细胞进行研究等,因为涉及人伦道德、受试者权益和隐私等问题,均需在研究开始前申请伦理审查,得到伦理委员会同意后方可进行试验。

但根据2023年卫健委刊发《涉及人的生命科学和医学研究伦理审查办法》文件解读,考虑到基础研究活动大多不直接涉及人体试验,部分研究也并不直接涉及研究参与者的临床诊疗信息,借鉴国际通行的做法,为提高审查效率,减少科研人员不必要负担,《办法》规定了“在使用人的信息数据或者生物样本、不对人体造成伤害、不涉及敏感个人信息或者商业利益的前提下”,部分情形的涉及人的生命科学和医学研究可以免除伦理审查。

如:使用已有的人的生物样本开展研究,所使用的生物样本来源符合相关法规和伦理原则,研究相关内容和目的在规范的知情同意范围内,且不涉及使用人的生殖细胞、胚胎和生殖性克隆、嵌合、可遗传的基因操作等活动的。

因此,单纯使用已有的菌落标本(如检验科已有的大小便标本等),进行体外培养和研究不需要伦理;但是涉及额外人体取样、使用患者临床信息等,需要通过伦理。

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